哈佛早期的校训是“真理”（Veritas，1643年）、“荣耀归于基督”（In Christ Gloriam，1650年），以及“为基督·为教会”（Christo et Ecclesiae，1692年）；印章展示三本翻开的书本，两本面向上，一本面向下，象征着理性（reason）与启示（revelation）之间的互动。一份最早期的文献——1642年的学院法例写道：“让每一位学生都认真考虑以认识神与耶稣基督为永生之源（约17:3），作为他人生与学习的主要目标，因而以基督作为一切正统知识和学习的惟一基础。所有人既看见主赐下智慧，便当在隐密处认真借着祷告寻求他的智慧。”这些校训都是在美国建国前的宗教单一时期定下的。

后来，为符合圣经尊重全人类自由意志但需提供平等的知识受教权发展的学术自由原则，美国取消了基督宗教的唯一性，以宗教中立取而代之。追求真理和发展科学文化教育的事业逐渐兴旺，哈佛大学校训最终确定为“真理