克莱顿（Clayton）

克莱顿校区占地面积超过1.1平方公里，是蒙纳士大学的旗舰校区。克莱顿是艺术、商业和经济、教育、工程、信息技术、法律、医学、护理、健康科学、理学学院的所在地。各种主要的科研机构及设施均设于此校区，其中最主要的是澳大利亚同步加速器和澳大利亚联邦科学与工业研究组织（CSIRO）。克莱顿拥有独立的邮政编码，校园里还有许多餐馆和零售店、学生酒吧Sir John's（位于校园中心）、诺丁山酒店（Notting Hill Hotel）以及6个学生宿舍楼。

考菲尔德（Caulfield）

考菲尔德校区是蒙纳士大学的第二大校区，位于墨尔本东南9公里。该校区是艺术、设计与建筑、商科、信息技术、新闻学的主要授课地点。

半岛（Peninsula）

位于墨尔本远郊弗兰克斯顿海湾郊区，是护理、健康科学、物理治疗、职业治疗、心理学的主要授课地点。同时，自从上世纪60年代维多利亚州立师范学院（State Teachers' College）与蒙纳士大学合并以来，该校区也提供幼儿和小学教育及商业与经济学的课程。

阿尔弗莱德（The Alfred）

位于墨尔本雅拉河南岸的阿尔弗莱德医院，设有两大学院——中心临床医学院、公共卫生与预防医学学院。该校区毗邻贝克心脏和糖尿病研究所（Baker Heart and Diabetes Institute）、伯内特研究所（Burnet Institute）、澳大利亚国立创伤研究中心（National Trauma Research Institute），是蒙纳士大学主要的医学研究中心。

帕克维尔（Parkville）

位于墨尔本中央商务区以北约2公里，是药学和制药科学学院的所在地。该学院主要从事药物配方科学和药物化学领域的科学研究，并提供药学学士学位和药物科学学士学位课程。此外，该校区还提供药学/商学、药物科学/工学双学位以及相关研究生学位课程。

出庭律师办公室（Law Chambers）

位于墨尔本法律中心区，步行即可到达裁判法院、郡法院和最高法院，提供法学硕士（LLM）和法律博士（JD）课程。

国际商学院（International Business School）

位于墨尔本中央商业区（专为国际贸易学士学位学生设立